Filsystem har inget att göra med vilken anslutningstyp den har till datorn. Det har däremot att göra med vilket/vilka operativsystem man använder och hur stora filer man har krav på att kunna lagra. FAT kan läsas av alla relevanta operativsystem (Windows, OS X och Linux) men kan inte lagra filer större än 4 gigabyte. Dessutom är det inte ett journalförande filsystem, vilket NTFS (Windows) och oftast HFS (OS X) är.
För att kunna byta filsystem från exempelvis FAT till HFS så måste man partitionera om hårddisken (även om det finns sätt att trixa sig runt detta om det skulle behövas).
Använder man Mac men har krav på att utbyta information med en annan Windows-dator och inte vill göra det via nätverk, så är FAT en väg att gå (och det går ju utmärkt att ha två partitioner med två olika filsystem på en hårddisk). Annars, välj aldrig FAT 🙂
Microsoft har nya filsystemet exFAT på gång sedan några år och nu är det på väg på riktigt. Det är en ersättare till FAT som låter oss lagra filer större än 4 gigabyte. Tyvärr är det vad jag förstår inte bakåtkompatibelt, vilket gör genomslagskraften tveksam om man får leka spåtant.